La carrera de doctorado constituye la alternativa de máxima titulación académica disciplinar dentro del marco de los estudios de posgrado de la Universidad de Buenos Aires. El doctorado comprende una capacitación superior orientada al desempeño profesional tanto en el ámbito docente como científico y tecnológico. Las áreas de doctorado que propone la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales son las siguientes:

• Ciencias de la Atmósfera y los Océanos (Res. CONEAU N° 121/2021)
• Ciencias Biológicas (Res. CONEAU N° 135/2022)
• Ciencias de la Computación (Res. CONEAU N° 032/2021)
• Ciencias Físicas (Res. CONEAU N° 200/2022)
• Ciencias Geológicas (Res. CONEAU N° 122/2021)
• Ciencias Matemáticas (Res. CONEAU N° 170/2022)
• Química Biológica (Res. CONEAU N° 091/2021)
• Química Industrial (Res. CONEAU N° 252/2021)
• Química Inorgánica, Química Analítica y Química Física (Res. CONEAU N° 320/2022)
• Química Orgánica (Res. CONEAU N° 319/2022)
• Paleontología (CONEAU Acta reconocimiento N° 546/2021)

El título otorgado es Doctor/a de la Universidad de Buenos Aires en el área correspondiente.

Los objetivos del Doctorado en la Facultad se enmarcan en lo dispuesto por la Resolución (CS) N° 1938/19 de la UBA. Consisten en formar a sus estudiantes en el método científico, especializándolos en las disciplinas que se estudian en la Facultad, y brindar capacidades y habilidades para abordar el estudio avanzado y la investigación científica. Para eso, la institución pone a disposición su plantel de profesores e investigadores, y su infraestructura, para facilitar la realización de un trabajo científico original de Tesis de Doctorado. La disciplina asociada con la realización del Doctorado puede ser diferente a la vinculada con el título de grado.

La definición de disciplina científica es entendida en un sentido amplio, flexible y moderno. En consistencia con su denominación, la Facultad estudia las ciencias estructuradas alrededor de la Matemática, Computación, Física, Química, Biología, Geología, Paleontología, Oceanografía y de la Atmósfera, impulsando los estudios interdisciplinarios (Fisicoquímica, Biofísica, Bioquímica, Biomatemática, etc.) y multidisciplinarios (Ciencias de los Materiales, de los Alimentos, del Ambiente, Ciencia de los Datos, etc). Su enfoque pretende superar la distinción esquemática entre las llamadas Ciencias Básicas y Aplicadas, promoviendo tanto los estudios fundamentales en la frontera del conocimiento de las disciplinas como las innovaciones y aplicaciones tecnológicas con una base científica sólida, adecuadas a las necesidades de la sociedad.